El servicio está constituido por tres laboratorios: laboratorio central, situado en el Parque Hospitalario Martí y Julià (Salt), el laboratorio de asistencia 24 horas, situado en el Hospital Universitario de Girona Doctor Josep Trueta y el laboratorio del Hospital de Campdevànol.
El centro de Bioquímica y Hematología se encuentra en el laboratorio central desde donde se da toda la actividad asistencial a los pacientes ingresados y ambulatorios mediante cadenas automatizadas de última generación. Las áreas de conocimiento más específicas, Inmunología, Serología, Genética y Biología Molecular, se encuentran también situadas en este laboratorio para dar todo el apoyo asistencial en aquellas pruebas de más complejidad.
El servicio de Microbiología está integrado completamente en el laboratorio, lo cual facilita la rotación de los residentes por esta sección. Las diferentes áreas del laboratorio están dotadas de toda la equipación disponible al mercado y el número de pruebas externalizadas es mínimo, factor muy importante, puesto que es un reflejo de la complejidad de nuestro centro.